Институт был создан в 1930 г по инициативе ак. В.Н. Шамова как Украинский институт переливания крови и гематологии,.Н.Шамов был его первым директором (1930-1934 гг.).
В 1932 г институт переименован в Украинский институт переливания крови и неотложной хирургии. В 1936 г. институт возглавил профессор. А.Л.Слободской, под руководством которого в период Великой Отечественной войны институт (1941-1943) выполнял функцию головной станции переливания крови по обеспечению кровью медучреждений фронтов.
В 1965 г институт был реорганизован в Харьковский НИИ общей и неотложной хирургии, его директором стал академик А.А. Шалимов. С именем ак. А.А. Шалимова связано становление современной хирургии и ее анестезиологического обеспечения не только в Харькове, но и в Украине.
С 1974 по 1999 г институт возглавлял проф. В.Т. Зайцев. Под руководством В.Т.Зайцева была создана школа хирургов-неотложніков, в том числе школа хирургической гастроэнтерологии.
В 2000 г. институт был передан в подчинение Академии медицинских наук Украины.
Сайт партнера http://ionh.com.ua